Akademiens forskningsinstitut har tillkommit för att utveckla angelägna forskningsområden, och är ofta finansierade genom donationer. Vid instituten och programmen skapas goda förutsättningar för Akademiens egna forskargrupper och för gästforskarverksamhet.
Flera av de institut som Akademien etablerat har efter hand vuxit och övergått helt till staten, till exempel Naturhistoriska riksmuseet, SMHI och Abisko naturvetenskapliga station. I dag driver Akademien fem institut och ett akademiprogram.
Anthropocene Laboratory
Anthropocene Laboratory startar upp sin verksamhet under 2023. Det övergripande syftet med programmet är att skapa och sprida vetenskapsbaserad förståelse och insikter för att identifiera och möjliggöra nya vägar mot en hållbar framtid. Fokus kommer att ligga på biosfären, jordens tunna lager av liv som människan är en del av.
Beijerinstitutet startade sin verksamhet på Akademien 1977. Sedan 1991 bedriver institutet studier i gränsområdet mellan ekologi och ekonomi. Bland forskningsprogrammen kan nämnas teman som äganderätter och andra institutioner, institutioner för hantering av naturresurser, buffertkapaciteten i ekologisk-ekonomiska system samt de ekologiska systemens samhällsnytta och ekonomiska värde.
Stiftelsen, som grundades 1791, har idag som huvuduppgift att finansiera den Bergianska professuren, Professor Bergianus. Den innehas av Hanna Johannesson och genom ett samarbete med Stockholms universitet bedriver hon sin forskning vid ett av universitetets forskningslaboratorier. Stiftelsen förvaltar också Edvard Andersons växthus, som är specialiserat på växter från medelhavsliknande klimat, och ett antal historiska samlingar av föremål, porträtt och herbarier.
Centrum för vetenskapshistoria
Institutet bildades 1988 och ger forskare möjlighet att studera Akademiens samlingar. Det är beläget i Akademiens byggnad i Stockholm, och handhar Akademiens arkiv och instrumentsamling samt dess Nobelarkiv.
Global Economic Dynamics and the Biosphere (GEDB) är ett femårigt tvärvetenskapligt forskningsprogram vid Kungl. Vetenskapsakademien som undersöker dynamiska kopplingar mellan globala miljö- och samhällsförändringar och mänsklighetens utveckling och välbefinnande. Programmet finansieras av Familjen Erling-Perssons stiftelse.
Institut Mittag-Leffler i Djursholm utanför Stockholm bildades 1916. Det är ett internationellt institut för matematik, dit forskare från hela världen inbjuds för forskningsarbete och diskussioner. Ett 100-tal gästforskare arbetar inom ett specialområde, som väljs för varje arbetsår, kring vilket verksamheten koncentreras. Seminarier öppna för alla intresserade anordnas regelbundet.
Swedish Institute for Global Health Transformation (SIGHT)
Institutet har som syfte att utifrån ett tvärvetenskapligt angreppssätt främja svensk forskning och utbildning inom global hälsa, och erbjuda vetenskapligt underlag för policyarbete inom området global hälsa.
I slutet av december 2022 lämnar SIGHT Kungl. Vetenskapsakademien för att övergå i en ny verksamhetsfas. Baserat på samarbete inom SIGHT University Network avser fyra svenska universitet att utveckla ett gemensamt center under 2023.
SIGHT vill tacka alla sina samarbetspartners sedan starten i januari 2017. Som vetenskaplig facilitator för tvärvetenskaplig forskning och tvärsektoriellt arbete har SIGHT och dess partners tillsammans bidragit till en förstärkt resursbas i Sverige och på den internationella globala hälsoarenan.